Jeśli wątek jest zawieszony, można użyć elementów sterujących krokami w celu krokowego wykonywania programu (wiersz po wierszu). Jeśli podczas wykonywania kroku napotkany zostanie punkt zatrzymania, proces wykonywania zostanie zawieszony w punkcie zatrzymania, a krok zostanie zakończony.
] w pasku narzędzi widoku lub naciśnij klawisz F6. Aktualnie wybrany wiersz zostanie wykonany, a proces zostanie zawieszony w następnym wykonywalnym wierszu.
] w pasku narzędzi widoku lub naciśnij przycisk F5. Zostanie wywołane następne wyrażenie z wiersza aktualnie wybranego do wykonania, a proces zostanie zawieszony w następnym wykonywalnym wierszu wywoływanej metody.
] w pasku narzędzi widoku Debugowanie lub naciśnij klawisze Shift+F5. Włączenie tej akcji spowoduje zastosowanie do każdej z akcji krokowych (przejście, wejście, do powrotu) zestawu filtrów kroków zdefiniowanych na stronie preferencji
Java > Debugowanie > Filtrowanie kroków. Po wywołaniu akcji kroku proces wykonywania krokowego będzie kontynuowany do momentu osiągnięcia miejsca nieobjętego filtrem lub do napotkania punktu zatrzymania.
] w pasku narzędzi widoku lub naciśnij przycisk F7. Proces wykonywania zostanie wznowiony do momentu wykonania następnej instrukcji powrotu w bieżącej metodzie i zostanie zawieszony w następnym wykonywalnym wierszu.
Gdy wątek jest zawieszony, można wznowić wykonywanie do momentu wykonania określonego wiersza. Jest to wygodny sposób zawieszenia wykonywania w określonym wierszu bez ustawiania punktu zatrzymania.
] lub naciśnij klawisze Ctrl+R. Wykonanie programu zostanie wznowione, a następnie zawieszone tuż przed wykonaniem wskazanego wiersza. Istnieje możliwość, że dany wiersz nigdy nie zostanie osiągnięty i wykonywanie programu nie zostanie zawieszone.
Punkty zatrzymania i wyjątki mogą spowodować, że wątek zostanie zawieszony przed osiągnięciem określonego wiersza.

Punkty zatrzymania
Perspektywy Java

Dodawanie punktów zatrzymania
Uruchamianie programu Java
Wznawianie wykonywania zawieszonych wątków
Wykonywanie i debugowanie
Ustawianie argumentów wykonywania
Zawieszanie wątków